次氯酸(HClO)的键角和水 (H2O)非常接近，因而更容易穿透细胞膜；次氯酸在杀菌、杀病毒过程中，不仅可作用于细胞壁、病毒外壳，而且因次氯酸分子小，不带电荷，可渗透入菌（病毒）体内与菌（病毒）体蛋白、核酸、和酶等发生氧化反应，从而杀死病原微生物；次氯酸(HClO)和次氯酸根(ClO-)，氯元素都是+1价，都具有氧化性，等量的次氯酸的杀菌消毒能力是次氯酸根的80-100倍！
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